Alors si le problème n'interviens que dans un seul des 3 Axe pense à changer de plan en utilisant Créer > Plan de Construction > Définir pour te mettre dans un plans qui contient l'axe dont tu as besoin (par exemple, te mettre en élévation et prendre le plan du mur pour jouer sur le positionnement verticale de ton linteau)
Dans le cas où tu n'arriverais pas du tout à le déplacer, vérifie qu'il n'est épinglé dans Modifier > Modifier > Verrouiller/Déverrouiller.
Et si le problème provient de la longueur de l'extrusion vide, regarde la profondeur de celle-ci.